Nautilus-114, é o nome de um navio interestelar que foi abandonada em uma lua de Júpiter Io (daí o nome do jogo) e os tripulantes desapareceu misteriosamente. Sua missão é ir até o altar e trazer de volta a todo custo.
No jogo, joga Ned, um membro da IAR federação em conjunto um pequeno robô Ned (que será a sua mão direita) deve passar o navio interestelar e trazê-la de volta, com o medo de não saber o que eles terão de enfrentar perigos ".